《審計報告》顯示，在對20個省（區、市）的審計調查中發現：去年，這些省（區、市）本級預算共編報中央稅收返還和補助收入3444.27億元，僅為中央實際補助7733.65億元的44.5%。按照報告中公開的數字，也就是說中國中央實際補助中有近4300億元未納入省（區、市）本級預算中。李金華表示，由於年初預算編報不完整，致使預算執行結果與年初預算出入較大，未編入預算的這部分資金實際上脫離了省級人大的審查監督。
另據不完全統計，2005年中國中央財政分配的239項專項轉移支付項目中，有41項存在內容交叉重複的問題，涉及資金156.37億元；有65項沒有管理辦法或管理辦法未公開，涉及資金705.89億元。近年來，隨著中國中央財政轉移支付數額的不斷增長，轉移支付的「不透明」狀態，日益引起社會關注甚至質疑。
不透明」是「跑部進錢」的罪魁禍首
2005年，15個中國中央部門在部門預算中共安排中央補助地方支出383.69億元。「中央給地方多少，為什麼要給，按照什麼比例，考慮哪些因素，外人一概不清楚。」北京大學財經法研究中心主任劉劍文教授在接受《中國經濟週刊》採訪時說。劉劍文表示，在轉移支付「不透明」的情況下，就比較容易出現尋租行為，也會滋生腐敗，包括貪污受賄。此外，資金的使用效率也值得懷疑，無法保障資金能得到最大限度地使用。也正是由於轉移支付的審批過程透明度低、公開性不夠，「跑部進錢」之風愈演愈烈。
「有的地方為了一個項目、一件事情，不停地往北京跑。省長跑，副省長跑，下面的人也跑。有的時候如開會期間，很多地方廳局長都集中到北京來。這一方面影響了政府機關的廉潔，另一方面也增加了行政成本。」國家審計署審計長李金華曾公開批評說。中國全國人大常委會副委員長成思危也曾笑稱，「我曾經說過，中秋節前北京堵車很嚴重，都是送月餅的。什麼時候中秋節前北京不堵車了，我們的政府工作可能就好多了。」
就在6月27日審計報告發布當日，也有中國人大常委會委員表示，現在各地方往發改委、財政、科技、交通、農業、水利等部門跑項目的情況越來越嚴重，「根源就在於目前不夠完善的轉移支付制度」。
根據《審計報告》顯示，2005年，15個中央部門在部門預算中共安排中央補助地方支出383.69億元。對此，李金華表示，這種由中央主管部門對口下達補助地方資金的做法，打亂了正常的預算管理級次和資金分配渠道，造成中央財政本級預算支出和補助地方預算支出不真實，不利於地方政府的管理和人大的監督。一些資金名義上是專項轉移支付，實際用作部門經費或系統內經費補助。
「這些資金是否經過審計，是否列入預算，並不透明！這樣的情況下怎樣可能保證分配公平、財政均等化呢？不可能的事情！」劉劍文教授評價說。事實上，除資金分配不透明外，專項資金的使用狀況也同樣令人堪憂。「地方不管項目最終能否建成，只管向中央爭取到錢。而中央的目標也是在分這塊錢。對當地實際情況沒有過多考慮或考慮很少。」審計署財政審計司司長侯凱說。
李金華更是明確指出，轉移支付過程中涉及到的很多人和很多部門甚至就在「吃」一些專項資金。而政府效能的評估現在也還沒有一個明確標準，這樣就出現了在轉移支付中不計成本去花錢的現象。(文章僅代表作者個人立場和觀點)
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