臺灣聯合報報導，消息人士指出，九一一事件對新疆獨分子有鼓舞作用，以爆炸、綁架和暗殺為手段的極端分子，頗有蠢蠢欲動的態勢。中國公安部門得到情報顯示，疆獨分子將在在大陸各大主要城市積極活動，其中又以北京最主。
消息稱，在北京的新疆人士有數萬之多，監管不易。過去北京有新疆村，成為治安死角。經過整頓，新疆村不復存在，新疆人士則分散各地。
北京市已加強在主要公眾場所的安檢，一些人潮聚集地，還加派便衣人員，如西單、天安門、王井府、大柵欄等地。
今年八月，中國軍方曾在新疆舉行反疆獨演習，消息稱，類似演習在這兩個月中不斷舉行。並透過外交途徑，要求「上海合作組織」的中亞國家，共同打擊新疆的分離和極端主義分子。
雖然中共外交部否認在九一一後逮捕上百名極端宗教主義分子，也否認有伊斯蘭領袖在新疆被捕。
但消息人士稱，中國的確趁國際反恐怖主義的機會，加強整頓隱藏在各地的疆獨人士，切斷疆獨與東土耳其斯坦組織的聯繫。
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